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内饰设计方面同样采取了一些新的元素。中控台不再处于一个平面之上，而是将中央部分下沉，增强车内的立体感。在工艺方面，雷克萨斯依旧保持着较高的水准，不仅模具的开发非常细致，并且对材质所呈现出的质感和按钮的触感都进行了细腻的改变，整体的内饰材质选择以软性材质和皮质为主。
CT200h的方向盘采用了三幅式的多功能运动方向盘，并依托于厚实的真皮包裹，获得良好的握感，大量功能按键则分布两边，布局合理井然有序。
平面式仪表盘采用了夜光白指针与黑底白字的方式搭配，中间为时速表，左侧表盘内为转速表和档位显示，右侧表盘上部为油箱表，下部是显示车辆基本信息的显示屏。仪表盘在Sport模式下背光为红色，在EV、Normal和Eco工作模式下，仪表盘为背光蓝色。
CT200h会有4种驾驶模式，分别是Normal、Eco、Sport和EV，其中在Eco模式下可以调节进气模式和气门开度，以保证最大的燃油经济性，Sport则会更好的动力和操控表现，并且仪表背光和中控台背景灯的颜色将从蓝色变成红色。
